Los ríos de Sonora más importantes son el Concepción, el Sonora, el Yaqui y el Altar, junto con los ríos Bavispe, Agua Prieta, Bacanora y Mayo. Otros ríos que pasan por el estado de Sonora, que está ubicado en el noroeste de México, son el Colorado, el Santa Cruz y el San Pedro, que nacen en Estados Unidos.
La mayor parte de estas corrientes de agua se originan en el norte del país con dirección al sur, pero casi ninguno de ellos por sí mismo desemboca en el mar, excepto durante las crecidas.
Río Sonora
Es una corriente de agua que nace en Arizpe, en la zona oeste de México, y termina en Hermosillo. Se forma por la confluencia de los ríos Bacanuchi y Bacoachi.
Tiene una longitud de 420 km, a través de los cuales pasa por los municipios de Bacoachi, Arizpe, Banamichi, Huépac, San Felipe de Jesús, Aconchi, Baviacora, Mazocahui y Ures hasta finalizar en Hermosillo.
Durante la época de inundaciones, este río desemboca en el océano Pacífico.
Río Yaqui
Es un río situado en el noroeste de México, que atraviesa el estado de Sonora de norte a sur. Mide 410 km de longitud, aunque se considera que al conectarse con el sistema Yaqui-Papigochi, una de sus afluentes, se extiende a 1,050 km aproximadamente.
Nace de la confluencia de los ríos Bavispe y Papigochi en la Sierra Madre Occidental, y desemboca cerca del pueblo de San Ignacio Río Muerto en el golfo de California. En su recorrido toma los nombres de río Papigochi, Sirupa, Huapoca, Aros y Yoqui.
Sus aguas son aprovechadas por las presas de El Novillo, Cárdenas, Álvaro Obregón y sirve para propósitos de irrigación agrícola en el Valle del Yaqui y Vicam.
Río Concepción
Se le conoce también con los nombres de río de la Concepción y río de la Asunción. Tiene una longitud de 335 km y atraviesa los municipios Imuris, Magdalena, Santa Ana, Benjamín Hill, Trincheras, Pitiquito y Caborca.
Su cuenca abarca unos 25,800 km2 y alimenta varias represas, entre ellas, Cuauhtémoc, Comaquito, el Plomo y la represa de Ignacio R. Pesqueira. Desemboca en el Golfo de California, en el Océano Pacífico.
Río Altar
Es un río desértico que corresponde a la cuenca del río Concepción, con 134,56 km de longitud, que nace en las cercanías de la frontera con Estados Unidos y desemboca en el río Magdalena.
Esta corriente de agua forma una cuenca de unos 2,801 km², que está localizada en la zona norte de Sonora.
Atraviesa los municipios de Nogales, Saric, Tubutama, Átil, Oquitoa, Altar y Pitiquito. Tiene un caudal medio de 1,561.84 mm³/s.
Río Bavispe
Nace en el municipio de Bavispe, en los límites con el estado de Chihuahua, y se encuentra en la cuenca hidrográfica del río Yaqui.
Su longitud es de 371 km, tiene un caudal de 1922.44 mm³ y pasa por los municipios Agua Prieta, Nacozari, Huasabas, Granados, Bacadehuachi y Divisaderos, Sahuaripa y Villa Hidalgo.
Río Agua Prieta
Este río nace en territorio estadounidense, está situado en el municipio de Agua Prieta, en los límites con el estado de Chihuahua.
Su cuenca hidrográfica es la del río Yaqui y pasa por los poblados de Agua Prieta, Cabullona y Colonia Morelos.
Río Bacanora
Está ubicado en el centro-este de Sonora, en la Sierra Madre Occidental. Nace en la Sierra El Encinal, que está ubicada al sureste de pueblo de Bacanora.
Pertenece a las cuencas hidrográficas de los ríos Yaqui y Mátape. Desemboca en el río Yaqui.
Río Mayo
Está localizado al sureste de Sonora. Nace en la Sierra Ocampo Chihuahua y desemboca en el golfo de California. Tiene un caudal de 863.24 mm³ y una longitud de 530 km.
Pasa por los municipios de Álamos, Navojoa, Etchojoa y Huatabampo.